Halosen ohjaamista dokumenttielokuvista ovat kansainvälistä mainetta osakseen saaneet "Ringside" (1992), "Veren perintö" (1993), "Karmapa - Jumaluuden kaksi tietä" (1998), "Karmapa - Matka maailman katolla" (1998) "Unelmoija ja unikansa" (1998), "Taivasta vasten" (2000) ja "Tynnyrimies" (2004).
"Karmapa - Jumaluuden kaksi tietä" voitti muun muassa Euroopan unionin humanitäärisen palkinnon. Maaliskuussa 2004 ensi-iltansa saanut "Tynnyrimies" palkittiin Italian Magma Short Cinema's Exhibition festivaalilla pääpalkinnolla sekä Krakovan elokuvafestivaaleilla kunniapalkinnolla. Kolme Halosen ohjausta on palkittu myös valtion elokuvataidetoimikunnan laatutuki-palkinnolla.
Arto Halonen on myös DocPoint - Helsingin dokumenttielokuvafestivaalin perustaja. Hän toimi DocPointin festivaali- ja taiteellisena johtajana vuosina 2001-2004. Lisäksi hän on toiminut dokumenttielokuvan kattojärjestön Dokumenttikillan puheenjohtajana ja hallituksen jäsenenä vuosina 2000-2003, Suomen elokuvakontaktin hallituksen jäsenenä vuodesta 2001 lähtien sekä Pohjois-Karjalan läänin elokuva- ja videotaiteen läänintaiteilijana vuosina 1989-1993.
Ohjaustyönsä ohella Halonen toimii myös tuottajana. Syksyllä 2005 valmistui Pontikkapitäjä (ohjaus Jarmo Jääskeläinen ja Auli Koponen) ja keväällä 2006 Tupakkatytöt (ohjaus Tarja Mattila). Lisäksi Arto Halonen toimii tuottajana parhaillaan tuotannossa olevissa dokumenttielokuvissa Yhden tähden hotelli (ohjaus Ari Matikainen) ja Voittajat ja voitetut (ohjaus Jarmo Jääskeläinen).
